IDENTIFIKASI MOLEKULER SPESIES BAKTERI PENYEBAB PENYAKIT HAWAR PADA KULTIVAR LOKAL SINGKONG ASAL KABUPATEN GUNUNGKIDUL

Penyakit yang banyak dilaporkan menyerang tanaman singkong adalah penyakit hawar bakteri. Informasi terkait identifikasi penyakit pada tanaman singkong lokal di Gunungkidul masih terbatas pada identifikasi morfologi patogen. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesies bakteri patogen penyebab hawar pada kultivar lokal singkong asal Gunungkidul. Penelitian ini menggunakan metode survei dan deskripsi. Metode survei digunakan untuk mengetahui penyakit hawar dengan melakukan identifikasi molekuler. Metode deskripsi digunakan dalam verifikasi hasil deteksi PCR. Parameter pengamatan meliputi observasi kejadian penyakit hawar pada berbagai kultivar singkong, karakteristik morfologi bakteri penyebab hawar, uji fisiologi bakteri, kualitas dan kuantitas DNA genomik singkong, dan ukuran produk PCR. Perlakuan deteksi molekuler menggunakan primer 16S rRNA dan primer rpoD. Hasil diperoleh deteksi molekuler patogen penyebab hawar pada kultivar lokal singkong asal Gunungkidul berhasil dilakukan melalui primer 16S rRNA dan hanya ditemukan pada kultivar Srondol. Hasil ini masih belum dapat mengkonfirmasi spesies Xanthomonas yang spesifik karena tidak terdeteksi pada primer rpoD.